An den Motorsteuereinheiten (MSE) werden die Fahrbefehle der Sonnenschutzzentrale verarbeitet und das örtliche Bedienelement (Taster/Rastschalter) angeschlossen. Die WAREMA Motorsteuereinheit ist immer dem Motor vorgeschaltet und mit einer Ausgangssicherung zum Schutz der Motorleitung (0,75 mm²) bei allen Aufputz- und REG-Varianten versehen.

WAREMA Motorsteuereinheiten gibt es in unterschiedlichen Ausführungen. Sie unterscheiden sich in der Ausgangsspannung (Anschluss eines 230 V AC oder 24 V DC).